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高考短信查分和网站查分可能存在差异，这可能是由于以下原因造成的。

1、数据更新速度不同：网站查询和短信查询的数据更新速度可能会有所不同，导致查询结果不一致，网站查询结果会更快更新，而短信查询可能会有一定的延迟。

2、查询途径不同：短信查询和网上查询是两种不同的途径，它们的数据来源也可能不同，有时查询结果可能会存在差异。

如果发现了不一致的情况，建议及时与相关部门联系，确认自己的考试成绩，无论使用哪种方式查询成绩，都需要保证信息的准确性和安全性，避免个人信息泄露或受到其他不必要的损失。